จากกรณีที่สำนักงานคณะกรรมการข้าราชการพลเรือน (กพ.) จัดทำร่างมาตรฐานกำหนดตำแหน่งใหม่ โดยสายงานเทคนิคการแพทย์ ถูกจัดอยู่ในกลุ่มงานสนับสนุน งานหลักทางเทคนิคเฉพาะด้าน (Technical support) ซึ่งส่วนใหญ่เป็นสายงานช่าง แทนที่จะถูกจัดอยู่ในกลุ่มงานบริการด้านสุขภาพ (Caring Service) เหมือนสายงานด้านสุขภาพอื่นๆ และสภาเทคนิคการแพทย์ได้ทำเรื่องแย้ง กพ. ว่า ให้ย้ายสายงานเทคนิคการแพทย์ จากกลุ่มสนับสนุนมาอยู่ในกลุ่ม caring และ research เช่นเดียวกับสายงานด้านสุขภาพอื่นๆ ในส่วนรายละเอียดคุณสมบัติและมาตรฐานกำหนดตำแหน่งก็ขอปรับเปลี่ยนแก้ไข เช่น การกำหนดวุฒิเทคนิคการแพทย์ และมีใบประกอบวิชาชีพ โดยอิงตาม พรบ.วิชาชีพเทคนิคการแพทย์ หน้าที่รับผิดชอบก็ขอให้ปรับแก้ไขหลายแห่ง ให้ตรงกับลักษณะงานที่ปฏิบัติจริง ซึ่งรายงานข่าวล่าสุด แจ้งว่าทางเลขาธิการ กพ.ได้มอบหมายให้คณะทำงาน ศึกษาเรื่องนี้แล้ว แต่ยังไม่มีรายงานความคืบหน้านั้น

       ผู้สื่อข่าวรายงานว่า ขณะที่การจัดสายงานเทคนิคการแพทย์ของ กพ. ยังไม่มีความชัดเจนว่าจะมีข้อสรุปเป็นอย่างไร ล่าสุดกลุ่มพัฒนาระบบบริหาร สำนักปลัดกระทรวงสาธารณสุข ซึ่งได้ทำการวิจัยเรื่องการพัฒนาระบบการเกษียณอายุ ตามลักษณะงานของข้าราชการกระทรวงสาธารณสุข ได้จัดเทคนิคการแพทย์ให้อยู่ในกลุ่มวิชาการ แทนที่จะเป็นกลุ่มวิชาชีพ อันหมายถึงผู้ปฏิบัติงานหลักในการให้บริการผู้ป่วย ในด้านวิชาชีพทั่วไป และวิชาชีพเฉพาะทาง และเป็นผู้ที่มีใบประกอบวิชาชีพโรคศิลปะสาขาต่างๆ ซึ่งนางคมเนตร เตียงพิทยากร กรรมการสภาเทคนิคการแพทย์ ได้เสนอเรื่องนี้ให้ที่ประชุมสภาฯพิจารณา เมื่อวันที่ 21 พฤศจิกายน 2549 ที่ผานมา และที่ประชุมสภาฯ มีความเห็นให้ทำหนังสือแย้งไปยัง กลุ่มพัฒนาระบบบริหาร เพื่อให้จัดเทคนิคการแพทย์อยู่ในกลุ่มวิชาชีพต่อไป